Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTLL13PA6NNM8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTLL13PA6NNM8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL13PA6NNM8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL13PA6NNM8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL13PA6NNM8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL13PA6NNM8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL13PA6NNM8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL13PA6NNM8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTLL13PA6NNM8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL13PA6NNM8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL13PA6NNM8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL13PA6NNM8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TTLL13PA6NNM8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL13PA6NNM8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TTLL13PA6NNM8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL13PA6NNM8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTLL13PA6NNM8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TTLL13PA6NNM8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TTLL13PA6NNM8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms