Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM247A6NEH6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM247A6NEH6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM247A6NEH6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM247A6NEH6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM247A6NEH6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms