Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LINC00862A6NCI5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00862A6NCI5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00862A6NCI5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00862A6NCI5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms