Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
VPS37CA5D8V6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
VPS37CA5D8V6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
VPS37CA5D8V6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
VPS37CA5D8V6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VPS37CA5D8V6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VPS37CA5D8V6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
VPS37CA5D8V6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
VPS37CA5D8V6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS37CA5D8V6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS37CA5D8V6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS37CA5D8V6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS37CA5D8V6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS37CA5D8V6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS37CA5D8V6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS37CA5D8V6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
VPS37CA5D8V6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
VPS37CA5D8V6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VPS37CA5D8V6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VPS37CA5D8V6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VPS37CA5D8V6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VPS37CA5D8V6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VPS37CA5D8V6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VPS37CA5D8V6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VPS37CA5D8V6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VPS37CA5D8V6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VPS37CA5D8V6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VPS37CA5D8V6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VPS37CA5D8V6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VPS37CA5D8V6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VPS37CA5D8V6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VPS37CA5D8V6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VPS37CA5D8V6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VPS37CA5D8V6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms