Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRP5LA4QPB2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRP5LA4QPB2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRP5LA4QPB2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRP5LA4QPB2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP5LA4QPB2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms