Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM221AA4D161 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM221AA4D161 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM221AA4D161 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM221AA4D161 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms