Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPDC1A2A3K4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPDC1A2A3K4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPDC1A2A3K4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPDC1A2A3K4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPDC1A2A3K4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPDC1A2A3K4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPDC1A2A3K4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPDC1A2A3K4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPDC1A2A3K4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPDC1A2A3K4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPDC1A2A3K4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPDC1A2A3K4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPDC1A2A3K4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPDC1A2A3K4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPDC1A2A3K4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPDC1A2A3K4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPDC1A2A3K4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms