Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 PTPRA-203ENST00000356147 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ANAPC5-208ENST00000535482 2077 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TTF1-201ENST00000334270 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AKNAD1-203ENST00000370001 3053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AIM2-202ENST00000368130 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC130464.1-201ENST00000416201 1500 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MARS2-201ENST00000282276 3019 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PRC1-202ENST00000394249 3034 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 INHBA-AS1-201ENST00000415848 3005 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ITSN1-211ENST00000399355 4003 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AF121897.1-201ENST00000411867 3980 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC093330.2-201ENST00000624814 3998 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SLFN13-211ENST00000542635 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MCF2-209ENST00000520602 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PPEF2-201ENST00000286719 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ENOX2-207ENST00000610637 2422 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TBC1D13-201ENST00000223865 3378 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PNPLA4-201ENST00000381042 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MAMDC2-AS1-204ENST00000448377 1923 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 HMMR-201ENST00000353866 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PDCD6IP-201ENST00000307296 6161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CNTNAP4-202ENST00000377504 4723 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 XYLB-201ENST00000207870 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ARHGAP12-202ENST00000344936 4128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CYP2C9-201ENST00000260682 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MYB-235ENST00000533624 1818 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MYB-238ENST00000534044 1812 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PPP4R1L-202ENST00000334187 2746 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 BUB1-212ENST00000535254 3576 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL354740.1-201ENST00000586726 2681 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 SPIN3-223ENST00000639525 3958 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 GUCY1A3-204ENST00000455639 2631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AP000542.3-201ENST00000623391 6114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 COLQ-203ENST00000383788 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DNAH2-203ENST00000572933 14955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MIR636-201ENST00000384825 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP20-1Q3LI63 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms