Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRMP28827 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 ZNF791-202ENST00000446165 6412 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
PTPRMP28827 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 SPATA13-201ENST00000343003 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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PTPRMP28827 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PTPRMP28827 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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