Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TRPM3-210ENST00000377111 4618 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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COL4A6Q14031 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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COL4A6Q14031 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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