Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 IGKV1OR2-3-201ENST00000411475 288 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AL645568.1-202ENST00000437190 1016 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 SUPT7L-205ENST00000464789 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 TATDN2P1-201ENST00000443767 2331 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 SYNJ2-IT1-201ENST00000442328 599 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 SYNPR-208ENST00000472899 527 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 AC015871.4-201ENST00000624650 2260 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RAB23Q9ULC3 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms