Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC105345.2-201ENST00000515186 664 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 LINC02389-202ENST00000540024 557 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL049844.1-201ENST00000545614 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 AC009063.2-201ENST00000563981 906 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 IL13-206ENST00000617259 498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AC087072.2-201ENST00000621060 682 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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RTL8BQ17RB0 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
RTL8BQ17RB0 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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