Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AL354733.2-202ENST00000615485 742 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 MIR6834-201ENST00000622807 81 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 SERPINA11-201ENST00000334708 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
HLA-DQB1P01920 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 BCL2L15-202ENST00000393316 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 CES5AP1-201ENST00000400418 859 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 MED15P8-201ENST00000411601 545 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL137027.1-201ENST00000440358 444 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL441992.1-201ENST00000443631 544 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC022639.1-201ENST00000523191 573 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC135388.1-201ENST00000536512 353 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL355076.3-201ENST00000555838 587 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 LINC02180-201ENST00000566439 1010 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 OR1K1-201ENST00000277309 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 KCNIP2-202ENST00000343195 663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 RPL23AP7-201ENST00000391616 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AAMDC-202ENST00000393427 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL590729.1-201ENST00000427046 573 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 AP006193.1-201ENST00000440724 485 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 PRSS48-201ENST00000441586 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HLA-DQB1P01920 TTC21B-AS1-202ENST00000443032 544 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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