Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC097375.1-201ENST00000507949 488 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC243830.2-201ENST00000618067 630 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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USP18Q9UMW8 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 TTN-AS1-265ENST00000627661 806 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 AC063952.4-201ENST00000634744 825 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP18Q9UMW8 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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