Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CRADD-210ENST00000552033 622 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 MIR4262-201ENST00000578394 54 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC010530.1-201ENST00000602844 569 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC007262.1-201ENST00000604099 321 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 PSORS1C1-201ENST00000259881 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 S100A4-201ENST00000354332 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL604028.1-201ENST00000430643 598 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 B4GALT4-209ENST00000471675 712 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC018541.1-201ENST00000517706 764 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 RAP1B-230ENST00000543697 734 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 PEX11A-205ENST00000561257 978 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AL583859.2-202ENST00000602311 505 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 LINC00632-203ENST00000602535 723 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 PRSS3P3-201ENST00000612253 692 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 AC010320.5-201ENST00000619124 676 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDK4Q16654 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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