Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 ZMYND11-216ENST00000602682 1687 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 LDHB-201ENST00000350669 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AC021231.1-201ENST00000559246 1342 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 ARNTL2-201ENST00000261178 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 PLA2G2C-201ENST00000247992 453 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 OR4D9-201ENST00000329328 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 LEMD1-202ENST00000367151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 LEMD1-204ENST00000367153 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 NR1I3-206ENST00000367984 1059 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 IMPG1-203ENST00000369963 868 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 LEMD1-206ENST00000391936 727 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 OCM-202ENST00000416608 623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AC011753.2-201ENST00000425576 610 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AC021106.2-201ENST00000505310 710 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AC120193.1-204ENST00000519689 651 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 TCEA1-206ENST00000520534 635 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 WARSP1-201ENST00000533936 454 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 ILF2P2-201ENST00000547482 1117 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AC026111.1-201ENST00000551090 1195 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AC024270.1-201ENST00000559181 404 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 RN7SL49P-201ENST00000581392 298 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 Metazoa_SRP.123-201ENST00000616695 286 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 ZNHIT3-209ENST00000620324 834 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AP000590.1-201ENST00000624943 464 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AL109653.2-201ENST00000625029 1065 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 RNF145-211ENST00000521606 2658 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 TRBV6-1-201ENST00000390353 401 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PSMB9P28065 NIP7P3-201ENST00000404319 515 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms