Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A3BPQ9Y5P4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A3BPQ9Y5P4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms