Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KCNIP3Q9Y2W7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms