Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDAC5Q9UQL6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC5Q9UQL6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms