Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTF2Q9UNY4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTF2Q9UNY4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms