Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP8AP2Q9UKL3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP8AP2Q9UKL3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms