Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNA3Q9UI47 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNA3Q9UI47 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms