Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHORDC1Q9UHD1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHORDC1Q9UHD1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms