Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP35Q9P2H5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP35Q9P2H5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms