Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHPF2Q9P2E5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHPF2Q9P2E5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms