Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARHGEF12Q9NZN5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ARHGEF12Q9NZN5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ARHGEF12Q9NZN5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ARHGEF12Q9NZN5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARHGEF12Q9NZN5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ARHGEF12Q9NZN5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms