Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD3Q9NYL9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms