Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPTLC3Q9NUV7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPTLC3Q9NUV7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms