Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UFSP2Q9NUQ7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms