Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATG3Q9NT62 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG3Q9NT62 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms