Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DUOX1Q9NRD9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DUOX1Q9NRD9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms