Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
INCENPQ9NQS7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms