Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRC4Q9NPP4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRC4Q9NPP4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRC4Q9NPP4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRC4Q9NPP4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRC4Q9NPP4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRC4Q9NPP4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRC4Q9NPP4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRC4Q9NPP4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRC4Q9NPP4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms