Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FANCFQ9NPI8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms