Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC3GQ9HC16 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC3GQ9HC16 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms