Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD3Q9H7B4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms