Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF3Q9H4D5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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