Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3C7

GGNBP2, Gametogenetin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP2Q9H3C7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGNBP2Q9H3C7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GGNBP2Q9H3C7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms