Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDCL3Q9H2J4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms