Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIPCQ9C0C6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms