Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMES1Q9C002 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms