Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms