Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GABARAPL3Q9BY60 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABARAPL3Q9BY60 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms