Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms