Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SNHG12Q9BXW3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SNHG12Q9BXW3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms