Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TDRD1Q9BXT4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms