Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms