Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYCP2Q9BX26 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SYCP2Q9BX26 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms