Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP58Q9BVL2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP58Q9BVL2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms