Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KATNB1Q9BVA0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms